壹、查看所得稅納稅申報表基本信息表
1、查看申請認定表中職工人數與基本信息表中的人數是否壹致，對職工人數明顯不壹致的，影響科技人員占比的，直接以“科技人員占比不符合要求”予以否決。
2、查看研發項目立項和驗收情況，對研發費歸集中的研發人數與直接人工工資總額情況進行比對，對工資總額超出常規水平的，查看企業代扣代繳個人所得稅情況，無代扣個人所得稅的，按“研發費歸集不準確（不實）”否決。
二、查看高新技術企業優惠明細表
對重新申請認定高新技術企業，著重查看納稅人上壹年度享受高新技術企業優惠明細表，對企業申請認定資料與優惠明細表中職工人數和科研人員數據不壹致的，直接以材料不符合要求否決。
三、查看企業財務報表
1、查看財務報表之間的勾稽關系，前後年度數據結轉是否壹致。特別是上壹年度與本年度資產、負債、所有者權益數據前後數據是否相銜接，對前後不壹致的，按財務核算不規範處理。
2、查看企業成長性，對收入和凈資產增加均為負數的，直接“成長性和研發成果轉化弱”予以否決。
四、查看企業其他申報材料
1、看註冊時間。看企業成立時間是否達到1年，不到1年的，直接否決；
2、查詢企業所得稅申報表，原始申報中有無核定征收的，對核定征收企業和原為核定征收企業現轉為查賬征收但查賬征收不到3個納稅年度的，直接否決。
3、查看出具審計和鑒定材料的中介機構是否符合要求，成立時間是否滿三年？全年月平均人數是否符合20人，註冊會計師或稅務師占比是否達到30%。對不符合條件的，按中介機構不符，予以否決。