個人投資建蓋的廠房因政府拆遷，所得的拆遷補償款是不需要繳納個人所得稅的。個人獨資企業廠房動遷所獲得的補償是免征個人所得稅的，國家在補償時會給予房屋拆遷費，搬遷費以及其他所有涉及經濟利益的補償。
根據《財政部國家稅務總局關於城鎮房屋 拆遷 有關稅收政策的通知》，經國務院批準，現將城鎮房屋拆遷有關稅收政策通知如下：
1、對被拆遷人按照國家有關城鎮房屋拆遷管理辦 法規 定的標準取得的 拆遷補償 款，免征 個人所得稅 。
2、對拆遷居民因拆遷重新購置住房的，對 購房 成交價格中相當於拆遷補償款的部分免征 契稅 ，成交價格超過拆遷補償款的，對超過部分征收契稅。
關於拆遷的具體補償：
1、房屋拆遷費：要按廠房的標準給予補償，標準各地不壹，如果沒有房產證，只能按違章建築補償，如壹間房子算做四面圍墻，壹塊壩子。
2、構附著著物補償費：包括地壩、水池、植物、道路、堡坎等等，各類標準不壹，但都是政策規定死了的，清點時不遺漏時就行。
3、搬遷費：如果是正規註冊的企業，可以移動的設備、廠房內的其他設施搬遷費用，由自己根據搬遷數量、距離做測算，雙方商定。若提前搬遷還有獎勵費用。
綜上所述，個人廠房拆遷不需要交稅。
法律依據：
《關於城鎮房屋拆遷有關稅收政策的通知》第壹條
對被拆遷人按照國家有關城鎮房屋拆遷管理辦法規定的標準取得的拆遷補償款，免征個人所得稅。
第二條
對拆遷居民因拆遷重新購置住房的，對購房成交價格中相當於拆遷補償款的部分免征契稅，成交價格超過拆遷補償款的，對超過部分征收契稅。