根據《個人所得稅法》以及相關政策規定，勞動者的工資個人所得稅可以通過年度匯算退稅或者每月申報退稅的方式進行。具體操作方式如下：1. 年度匯算退稅：在次年3月1日至6月30日期間向稅務機關提出申請，按照個人所得稅法規定的計算方法，確認應當退還的稅款；然後，填寫《個人所得稅匯算清繳表》，並攜帶相應的證明材料，到稅務機關辦理匯算退稅手續。2. 每月申報退稅：在每個納稅期內，根據當月的實際情況填寫《個人所得稅申報表》，同時申報退稅；在繳納當月工資時，經過稅務機關審核確認退稅金額後，由企業代扣代繳。需要註意的是，兩種退稅方式的條件和適用範圍有所不同。年度匯算退稅壹般適用於工資較高、收入來源復雜等情況；每月申報退稅則更適用於月收入不超過5000元、僅有工資所得的勞動者。
如何進行工資個人所得稅預扣預繳？工資個人所得稅的預扣預繳是指雇主在支付工資時，按照國家規定的稅率和稅法規定的方法，預先扣除應納稅額，並代為繳納給稅務機關。具體操作方式是：雇主在支付工資時，先按照個稅起征點(2023年為6000元)確定納稅人的免征額；然後按照稅率表確定適用稅率，計算出實際應納稅額，最後扣除免征額後代為繳納給稅務機關。
工資個人所得稅退稅是勞動者的合法權益之壹，可以通過年度匯算退稅或每月申報退稅的方式進行。在實際運營中，企業需要認真履行代扣代繳義務，並及時將應繳納的個人所得稅款繳交給稅務機關；勞動者則需要了解有關個人所得稅的政策法規，及時申報退稅。
法律依據：
《中華人民***和國個人所得稅法》第十四條 扣繳義務人每月或者每次預扣、代扣的稅款，應當在次月十五日內繳入國庫，並向稅務機關報送扣繳個人所得稅申報表。納稅人辦理匯算清繳退稅或者扣繳義務人為納稅人辦理匯算清繳退稅的，稅務機關審核後，按照國庫管理的有關規定辦理退稅。