(壹)規範財務管理制度，加強發票憑證審核。
重大稅收違法案件的標準主要是偷稅、騙取出口退稅和虛開發票。發票是企業經營的稅務監管證據，企業購銷商品和提供勞務的核心證據是交易過程記錄，包括合同、商品產權轉移證明、資金收支證明等。因此，企業的日常會計憑證和出口審核憑證應盡可能完整、真實，以避免虛開和騙稅的風險。
(二)檢查結束後，積極與稅務局溝通和自查。
納稅評估和稅務檢查是稅務機關收集和比較企業涉稅信息的過程，兩者之間存在信息不對稱。納稅人應在保護自身利益的前提下積極與稅務機關溝通，對稅務機關提出的涉稅問題進行自查，或補充資料，或尋找政策依據。通過溝通化解風險是企業的最佳選擇。在這個環節中，要尋求專業律師的協助，提高溝通有效性，降低涉稅法律風險。
在檢查過程中，納稅人的陳述申辯和聽證權利受到稅收征管法和行政處罰法的保護。因此，納稅人可以通過非正式溝通或法律程序陳述事實，表達意見，甚至與稅務局爭論。
(三)積極準備復議和訴訟。
檢查審理後，稽查局下達稅務處理處罰決定書。企業認定的涉稅問題，符合黑名單標準的，將作為違法信息公布，由多部門聯合懲戒。企業經營活動受限，信用為零，舉步維艱。
首先，如果事實認定清楚，法律適用準確，應及時繳納稅款和罰款，避免因久稅而被認定為重大稅收違法案件。
其次，如果存在事實不清、適用法律錯誤、違反法定程序等情況。，要做好復議和訴訟準備，推翻處罰決定，維護企業合法權益。
(四)被公告為重大稅收違法行為的納稅人，應及時補繳長期稅款，修復企業信用。
新修訂的《重大稅收違法案件信息公布辦法》增加了信用修復的規定。
符合本條第(壹)項、第(二)項情形的重大稅收違法案件當事人能夠按照稅務處理決定和稅務行政處罰決定繳納稅款、滯納金和罰款的，實施檢查的稅務機關決定只將案件信息錄入重大稅收違法案件信息系統，不對外公開案件信息。
案件信息已向社會公布，當事人已及時繳納稅款、滯納金和罰款的，實施檢查的稅務機關決定停止公布並退出公告欄，通知實施聯合懲戒管理的部門補繳稅款。
法律依據:《中華人民共和國公司法》
第六條設立公司，應當依法向公司登記機關申請設立登記。符合本法規定的設立條件的，由公司登記機關分別登記為有限責任公司或者股份有限公司；不符合本法規定的設立條件的，不得登記為有限責任公司或者股份有限公司。
法律、行政法規規定設立公司必須經批準的，應當在公司登記前依法辦理批準手續。
公眾可以向公司登記機關申請查詢公司登記事項，公司登記機關應當提供查詢服務。
第七條依法設立的公司，由公司登記機關核發營業執照。公司營業執照簽發日期為公司成立日期。
公司營業執照應當載明公司名稱、住所、註冊資本、經營範圍、法定代表人姓名等事項。
公司營業執照記載的事項發生變更的，公司應當依法辦理變更登記，由公司登記機關換發營業執照。