環保稅是通過各地人民代表大會常務委員會在法定稅額幅度內決定法定稅額幅等方式進行征收。據悉，作為中國第壹部專門體現“綠色稅制”、推進生態文明建設的單行稅法。
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目前，遼寧、吉林、安徽、福建、江西、陜西、甘肅、青海、寧夏和新疆等省份明確應稅大氣汙染物和水汙染物適用稅額根據環保稅法確定的最低限額征收，即每汙染當量分別為1.2元和1.4元。
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而浙江、湖北、湖南、廣東、廣西和西南地區的貴州、雲南等省（自治區）制定的稅額均略高於環保稅法規定的最低稅額。其中，雲南規定，2018年1月至12月，環保稅稅額為大氣汙染物每汙染當量1.2元，水汙染物每汙染當量1.4元；從2019年1月起，大氣汙染物每汙染當量2.8元，水汙染物每汙染當量3.5元。
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江蘇、海南和四川確定的稅額適中。其中，江蘇規定大氣汙染物和水汙染物征收稅額分別是每汙染當量4.8元和5.6元，四川為3.9元和2.8元。京津冀和周邊省份則普遍對大氣汙染物和水汙染物確定了較高的具體適用稅額。日前召開的北京市人大常委會決定，北京市應稅大氣汙染物適用稅額為每汙染當量12元，應稅水汙染物適用稅額為每汙染當量14元，均按環保稅法規定的稅額幅度上限執行。河北省將環保稅大氣主要汙染物和水主要汙染物稅額分為3檔，分別按照環保稅法規定的最低標準的8倍、5倍和4倍執行。最高壹檔稅額為：應稅大氣汙染物每汙染當量9.6元，應稅水汙染物每汙染當量11.2元。其他汙染物實行全省統壹標準，按環保稅法規定的最低稅額的4倍執行。
除北京市、河北省稅額較高之外，山東省也將執行較高的大氣汙染物稅額，但將對不同種類的大氣汙染物區別對待。根據該省確定的方案，應稅大氣汙染物中的二氧化硫、氮氧化物稅額為每汙染當量6元，其他大氣汙染物每汙染當量1.2元。
稅法規定，納稅人應當向應稅汙染物排放地的主管稅務機關申報繳納環保稅。環保稅按月計算，按季申報繳納。不能按固定期限計算繳納的，可以按次申報繳納。
根據稅法，納稅人應當自季度終了之日起十五日內，向主管稅務機關辦理納稅申報並繳納稅款；按次申報繳納的，應當自納稅義務發生之日起十五日內，向稅務機關辦理納稅申報並繳納稅款。