所有銷售發票數據和輸入認證數據都被輸入稅務局的計算機系統。理論上，稅務局要求開具增值稅專用發票的壹般納稅人，在開具增值稅專用發票前，必須確認對方也是壹般納稅人。對方拿到增值稅專用發票後，即使不能作為進項抵扣，也要經過認證(數據錄入稅務局系統)，然後轉出進項稅。
在180開具輸出發票後，輸入認證的數據肯定可以進行比對。但現實中，很多普通納稅人(購買者)拿到按照稅收規定不能抵扣的發票，並不進行認證，而是直接將總價和稅金計入成本。
所以到目前為止，稅局基本都是從輸入數據中尋找相同的輸出數據。另壹方面，也不太可能因為只有壹兩張發票與輸入數據不符(對方沒有認證)，而讓壹家公司進行專項調查。當然，對於壹個公司來說，很多輸出發票在180之後無法對應到他們系統中的輸入數據，稅務局會懷疑該公司是否有稅務異常。
擴展數據
保留發票的處理
1.如果企業取得了不能抵扣的專用發票，壹種方式是要求銷售方重新開具普通發票，另壹種方式是拿發票進行認證抵扣，但同時會全額轉出。
2.買方購買免稅商品和非應稅項目的，應當要求賣方開具普通發票。
3.在買方為小規模納稅人期間，要求賣方開具普通發票。
4.如果買方收到專用發票超過180天，無法進行抵扣認證，買方應在180天內對管理流程進行自查並盡快進行認證。