1、經濟統計學專業
本專業適應統計學專業發展趨勢和市場需要，結合我校財經類院校的特點，以“夯實數理基礎、註重學科交叉、強化實踐訓練”為專業建設指導思想，註重學生統計思維和統計方法的訓練，加強統計學與經濟學和管理學的交叉整合，強調應用統計方法分析和解決經濟、金融和管理領域的實際問題。學生考研率高、就業面寬、就業去向好。
2、財政學專業
本專業於1995年正式被批準設置並招收本科學生，多年來依托行業背景、審計事業的發展需求和市場經濟發展的需要，積極探索，形成了以“財政審計”為特色的財政學專業人才培養模式。為各級政府部門、經濟管理部門、中介機構、企事業單位等輸送了大量的從事財務、財稅審計、稅務籌劃等的應用型專業人才。
3、投資學專業
金融學院投資學專業是江蘇省新辦專業，填補江蘇省高等院校專業空白。該專業有壹支雙師型的師資隊伍，教師具有豐富的行業經驗，重點建設投資銀行、金融工程、證券與基金等課程，拓展銀證合作方向，教學實踐環節突出。
4、計算機科學與技術專業
在相互依存、協調發展的學科體系下，本專業培養學生在掌握計算機科學與技術的基本理論、基本知識和基本方法的同時，還初步具備運用計算機技術進行計算機審計的能力。培養方案中，設置了經濟、管理等相關課程，在國內率先開設了“計算機審計”、“信息系統審計”等課程，凸顯了計算機技術在審計中的應用特色。
5、財務管理專業
財務管理專業依托我院會計、審計專業優勢，學科基礎雄厚，畢業生就業前景好。本專業有壹支高質量的師資隊伍，教師來源於國內外重點高校，博士的比例占有30%，許多教師具有從事企業和各類理財和金融管理領域經濟分析、咨詢和決策的實踐經驗。
6、行政管理專業
該校行政管理專業立足公***管理學科，結合學校的“大審計”學科平臺，形成了以“公***部門績效管理與公***經濟管理”的專業特色。為了培養出既具有紮實理論基礎，又具有實踐能力的行政管理應用性人才，我校不斷完善行政管理專業的課程設置與實踐教學，既符合行政管理專業的人才培養需求，又充分體現南京審計學院的辦學特色。
以上內容參考：百度百科-南京審計大學