1、支付寶繳費：支付寶首頁點擊市民中心，選擇社保頁面繳費。輸入身份證號姓名，選擇城鄉居民醫療保險進行查詢，選擇城鄉居民基本醫療保險費，點擊繳費完成付款。
2、微信繳費：微信繳納合作醫療的方式有兩種，壹種是查詢當地的社保部門是否開通了新農合繳納的公眾號，然後搜索當地的公眾號按照流程進行繳納即可；第二種是在微信中查詢城市服務，找到城鄉居民醫療保險，按照提示進行繳納即可。
3、官網繳費：登錄當地所處城市的社會保險網上申報服務平臺，進入網上自助繳費界面，輸入姓名、身份證號碼，閱讀接受打鉤，完成短信驗證後會顯示參保人相關信息，確認無誤後就可以點擊支付。
4、銀行APP繳費：目前農業銀行、工商銀行、中國銀行、農商銀行等提供手機銀行社保費繳費業務。所在地稅務局簽約以上銀行的繳費人可以從中選擇，具體繳費步驟根據各銀行界面提示進行操作。
醫療保險的作用
1、保障醫療服務需求：
醫療保險為人們提供了壹定的醫療保障，使得人們在遇到意外或突發疾病時能夠得到必要的醫療服務和護理，緩解了人們在醫療服務需要方面的壓力。
2、分擔醫療支出：
實現醫療支出的社會化，防止大規模疾病或個人突發疾病給家庭造成的經濟負擔過重。醫療保險的存在，能夠有效地分擔大部分的醫療支出，從而減輕人們的經濟與生活壓力。
3、促進醫療資源合理配置：
醫療保險的實施可以增加醫療服務的需求，從而促進醫療資源的合理配置，鼓勵醫療機構改善服務質量，提高醫生的業務水平，保障患者的醫療權益，形成了壹個良性的醫療服務體系。
4、調節醫療市場價格：
醫療保險作為壹種市場調節手段，可以通過政策引導的方式，控制醫療市場價格過高和患者自負過多的現象，保證患者能夠獲得醫療服務的公平性和合理性。
綜上所述，農村合作醫療在網上交的方法有支付寶繳費、微信繳費、官網繳費、銀行APP繳費等。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》
第二十四條
國家建立和完善新型農村合作醫療制度。
新型農村合作醫療的管理辦法，由國務院規定。
第二十五條
國家建立和完善城鎮居民基本醫療保險制度。
城鎮居民基本醫療保險實行個人繳費和政府補貼相結合。
享受最低生活保障的人、喪失勞動能力的殘疾人、低收入家庭六十周歲以上的老年人和未成年人等所需個人繳費部分，由政府給予補貼。