辦理參保登記程序：
1、個人申請：
農村居民攜帶戶口簿、二代居民身份證原件和復印件到戶籍所在地村（居）委會提出參加農村醫療保險申請，選擇繳費檔次，填寫《新型農村社會醫療保險參保登記表》（以下簡稱《參保登記表》）壹式二份。
2、村協理員檢查：
村協理員負責檢查《參保登記表》、《農村戶籍老年人家庭社會關系表》是否填寫完整，填寫的姓名、二代身份證號碼等信息是否準確，是否有個人簽字或蓋章、按手印，檢查參保人員提供的相關材料是否齊全。
3、鄉鎮初審：
鄉鎮勞動保障事務所對村裏上報的參保登記有關材料進行初審，審核無誤後，經辦人員在《參保登記表》上簽字，加蓋鄉鎮保障所公章，及時將參保人員的基本信息錄入新農保信息系統，將《參保登記表》、二代居民身份證和戶口簿復印件等材料上報縣農保中心。
4、縣農保中心復核
縣農保中心收到鄉鎮上報的參保登記有關材料及時進行復核，無誤後，對鄉鎮勞動保障事務所錄入的參保人員基本信息進行確認，為參保人員建立個人賬戶；在《參保登記表》簽字、蓋章，將有關材料歸檔備案。
綜上所述，農村農保繳費可以通過銀行代收代扣、由社區村組或學校代收以及稅務征收，通過稅務局線上小程序進行繳費，現在農村農保整合為城鄉居民醫保。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》
第二十四條
規定：國家建立和完善新型農村合作醫療制度。新型農村合作醫療的管理辦法，由國務院規定。