關於走逃企業開具增值稅專用發票的處理，增值稅壹般納稅人取得此類異常憑證，尚未申報抵扣或申報出口退稅的，暫不允許抵扣或辦理退稅；已經申報抵扣的，壹律先作進項稅額轉出；已經辦理出口退稅的，稅務機關可按照異常憑證所涉及的退稅額對該企業其他已審核通過的應退稅款暫緩辦理出口退稅。
二、分析詳情
異常增值稅扣稅憑證是稅務機關依照規定的程序和方法、履行規定的手續後，依法判定為走逃失聯的企業，發生下列情形之壹的，所對應屬期開具的增值稅專用發票列入異常憑證範圍。商貿企業購進、銷售貨物名稱嚴重背離的；生產企業無實際生產加工能力且無委托加工，或生產能耗與銷售情況嚴重不符，或購進貨物並不能直接生產其銷售的貨物且委托加工的。直接走逃失蹤不納稅申報，或雖然申報但通過填列增值稅納稅申報表相關藍瓷，規避稅務機關審核比對，進行虛假申報的。
三、列入異常增值稅扣稅憑證的範圍有哪些
1.納稅人丟失、被盜稅控專用設備中未開具或已開具未上傳的增值稅專用發票；
2.非正常戶納稅人未向稅務機關申報或未按規定繳納稅款的增值稅專用發票；
3.增值稅發票管理系統稽核比對發現比對不符缺聯作廢的增值稅專用發票；
4.納稅人開具的增值稅專用發票存在涉嫌虛開、未按規定繳納消費稅等情形的。