1.法律地位不同:全國人民代表大會是最高國家權力機關，地方各級人民代表大會是地方國家權力機關，而CPPCC不產生“壹府兩院”，所以不存在“壹府兩院”，對CPPCC負責，受其法律監督和工作監督。
2.職能不同:根據憲法和法律，全國人大的職能可以概括為四個方面:立法權、任免權、監督權和重大問題決策權，而CPPCC的職能主要圍繞團結和民主兩大主題，切實履行政治協商、民主監督和參政議政職能。
3.性質不同:人民政治協商會議(CPPCC)是中國生產者黨領導的多黨合作和政治協商制度的重要機構，是中國人民愛國統壹戰線的組織，是中國特色社會主義民主的重要形式。所以不是中國的國家機構，是中國的國家機構。