深圳公司變更法人的流程是攜帶資料到公司註冊地所管轄的工商部門辦理執照變更，受理後5-10個工作日後領取新法人代表的執照；攜帶資料到質量監督管理局辦理企業組織機構代碼證變更，受理後2-3個工作日後領取；到稅務部門變更登記證。
法律客觀：《中華人民***和國市場主體登記管理條例》第二十四條 市場主體變更登記事項，應當自作出變更決議、決定或者法定變更事項發生之日起30日內向登記機關申請變更登記。 市場主體變更登記事項屬於依法須經批準的，申請人應當在批準文件有效期內向登記機關申請變更登記。 《中華人民***和國市場主體登記管理條例》第二十八條 市場主體變更登記涉及營業執照記載事項的，登記機關應當及時為市場主體換發營業執照。