施工企業異地預繳增值稅，需要先在地稅局或電子稅務局開具外貿證明，企業持合同、外貿證明、營業執照到項目所在地稅務局辦理預繳。現在有很多地方不需要上項目，只需要在電子稅務局操作，預繳的稅款可以在企業申報時抵扣。財政部《中華人民共和國國家稅務總局關於納稅人異地預繳城市維護建設增值稅和教育費附加有關問題的通知》(財稅[2016]74號)規定，納稅人跨地區提供建築勞務的，應當在建築勞務發生地預繳增值稅， 並按照預繳增值稅所在地的城市維護建設稅適用稅率和教育費附加征收率就地計算繳納城市維護建設稅和教育費附加。
法律依據:《中華人民共和國國家稅務總局關於發布的公告》第四條納稅人跨縣(市、區)提供建築勞務的，按照下列規定預繳稅款:
(壹)壹般納稅人跨縣(市、區)提供建築勞務，適用壹般計稅方法的，以取得的總價和價外費用扣除分包款後的余額，按照2%的扣繳率計算預繳稅金。
(二)壹般納稅人跨縣(市、區)提供建築勞務，選擇適用簡易計稅方法的，以取得的總價和價外費用扣除分包款後的余額，按照3%的稅率計算預繳稅金。
(三)對跨縣(市、區)提供建築勞務的小規模納稅人，以其取得的全部價款和價外費用扣除已支付的分包款後的余額，按照3%的稅率計算預繳稅金。
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