納稅人全申報成功且申報信息導入核心征管系統後，若納稅人沒有選擇預約扣款，則電子稅務局將會發起自動扣款，納稅人無須再進行手動操作。（扣款在上壹個扣款線程結束後的10分鐘時發起，預計最遲在導入核心征管系統後的30分鐘內扣款。）
預約扣款：納稅人進行全申報後，可根據系統提示將扣款方式選擇為預約扣款，並選擇預約的扣款時間，到了預約日系統自動發起扣款。