①如果賬務上已經確認了收入，但未確認相關的增值稅，
1、補做增值稅稅款分錄：
借：主營業務收入/其他業務收入
貸：應交稅費-增值稅檢查調整（壹般納稅人企業）/應交稅費-應交增值稅（小規模納稅人企業）
2、補繳稅款分錄：
壹般納稅人企業：
借：應交稅費-增值稅檢查調整
貸：應交稅費-未交增值稅
借：應交稅費-未交增值稅
貸：銀行存款
小規模納稅人企業：
借：應交稅費-應交增值稅
貸：銀行存款
3、罰款和滯納金：
借：營業外支出
貸：銀行存款
②如果賬務上漏記收入，可以參考如下分錄：
1、補做收入和稅款分錄：
借：應收賬款等
貸：主營業務收入
應交稅費-增值稅檢查調整（壹般納稅人企業）/應交稅費-應交增值稅（小規模納稅人企業）
2、補繳稅款、以及支付滯納金、罰款的分錄同情況壹。
跨年涉及以前年度損益科目時需要計入以前年度損益調整科目。小企業會計準則可以計入當期損益或是計入利潤分配-未分配利潤。
③存在失控發票，企業做進項稅額轉出處理：
借：相關成本費用（跨年涉及損益科目時計入以前年度損益調整）
貸：應交稅費-應交增值稅（進項稅額轉出）
借：應交稅費-應交增值稅（轉出未交增值稅）
貸：應交稅費-未交增值稅
借：應交稅費-未交增值稅
貸：銀行存款等。