市局設1個直屬機構,稽查局，級別為正科級。
稽查局負責組織、指導、協調和監督本系統的稅收檢查工作；負責對年度計劃確定的重點稅源企業和稅務違法案件的查處、審理、執行工作；組織貫徹稅務稽查規章制度，擬定具體實施辦法；負責稅收案件舉報的受理、轉辦工作；對下級稅收檢查情況進行復查復審；負責與公安、檢察、審判機關協調稅務稽查中的司法工作；負責金稅工程發票協查工作；負責牽頭組織稅收專項檢查工作；承辦領導交辦的其它工作。
市局稽查局設7個內設機構，即綜合科、選案（協查）科、檢查壹科、檢查二科、案件審理科、案件執行科、稅收違法案件舉報中心，級別為正股級。