除了向主管稅務機關報送年度財務報表外，根據《國務院關於印發註冊資本登記制度改革方案的通知》，企業還應在規定期限內通過市場主體信用信息公示系統向工商行政管理機關報送年度報告，並向社會公示。
財務報表不能申報。根據各地主管稅務機關發布的《關於規範納稅人財務會計報表報送管理的公告》，納稅人不論應稅收入、所得和其他應稅項目，不論在減免稅期間，都應向主管稅務機關報送財務會計報表。其中，財務報表的報告期壹般為季度，少數地區由於政策原因會按月報告。
企業財務報表的填報方式包括網上填報和現場填報。網上申報是指通過登錄主管稅務機關網站進行申報，前臺申報是指通過預約當地主管稅務機關進行現場申報。