1、登錄電子稅務局（申報端），選擇企稅年報。
2、在填報列表中必須勾選《A107010免稅、減計收入及加計扣除優惠明細表》和《A107012研發費用加計扣除優惠明細表》。
3、打開《A107012研發費用加計扣除優惠明細表》，根據研發費用會計賬和輔助賬，如實填入各項數據。
4、系統自動計算表中本年研發費用加計扣除總額（行次51），點擊保存。
5、打開《A107010免稅、減計收入及加計扣除優惠明細表》，確保加計扣除總額已經自動計入表中三、加計扣除（行次25），點擊保存。
6、打開匯算清繳主表，確保加計扣除額已經自動計入表中減：免稅、減計收入及加計扣除（填寫A107010）（行次17），點擊保存並提交申報。