按照加工行業，稅率為13%，然後征收後立即扣除70%，按照服務業扣除6%。醫療廢物處置企業免稅的做法是營改增之前的做法。其實這種做法早就被摒棄了。
目前醫療廢物處置企業的稅率確實“有點亂”。下壹步壹方面在全省統壹稅率，另壹方面積極爭取，向國家提出出臺醫療廢物處置企業稅收優惠政策。
目前，醫療廢物處理沒有特別的稅收優惠:
企業所得稅“三免三減”針對的是公共汙水處理、公共垃圾處理等項目；增值稅資源綜合利用產品和服務增值稅優惠目錄中的“垃圾”是指城市生活垃圾、農作物稭稈、樹皮廢渣、汙泥、合成革和化纖廢棄物、病死畜禽及其他養殖廢棄物等垃圾。以上政策均不包括醫療廢物，醫療廢物未列入目錄，不能享受企業所得稅減免優惠和增值稅即征即退政策。