在調查醫藥經銷企業虛開增值稅普通發票時，檢查查證（順查法）的關鍵是發票流向，延伸到相關醫療機構取證騙取或非法購買的增值稅普通發票使用情況。實際工作中也可采取逆查法，抽查省、市各級醫療機構財務資料，檢查是否存在虛假的增值稅普通發票入賬問題，以此發現虛開發票的醫藥經銷企業，合理選擇方式、靈活運用方法確保案件查辦工作高效順利。
醫藥價格虛高、醫藥行業成為虛開重災區不僅僅是稅法問題，而是諸多社會問題的外在表現。稅收作為壹種收入分配手段，具有壹定的宏觀經濟調控功能。