國家財政部和國稅局既不是隸屬關系，也不是上下級關系，是兩個完全獨立的部門。不過，兩者都歸屬於國務院管轄。
擴展資料：
中華人民***和國財政部是中華人民***和國負責財務的國務院組成部門。其前身為1949年10月1日成立的中央人民政府財政部。 2018年3月，根據第十三屆全國人民代表大會第壹次會議批準的國務院機構改革方案，將財政部有關農業投資項目管理職責整合，組建中華人民***和國農業農村部；將財政部的中央預算執行情況和其他財政收支情況的監督檢查的職責劃入中華人民***和國審計署。
國家稅務總局，為中華人民***和國國務院主管稅收工作的直屬機構。1998年3月29日，國務院發布《國務院關於機構設置的通知》（國發〔1998〕5號）；同年6月22日，國務院辦公廳關於印發《國家稅務總局職能配置內設機構和人員編制規定的通知》，正式設置國家稅務總局（正部級）。
2018年3月，根據中***中央印發的《深化黨和國家機構改革方案》，將省級和省級以下國稅地稅機構合並，具體承擔所轄區域內各項稅收、非稅收入征管等職責。
參考資料：
參考資料：