當印花稅逾期申報成為問題時，有特定的步驟可供遵循。首先，如果在整個稅期內所有印花稅項目均未申報，可以通過電子稅務局進行逾期申報。操作流程如下：進入電子稅務局，選擇稅源采集新增稅源信息，接著在主頁點擊我要辦稅-稅費申報及繳納-逾期申報進行操作。務必確保所有未申報的稅目都已采集，並壹並提交，否則無法逐壹通過電子稅務局申報。若逾期申報頁面未顯示全部稅目，可以嘗試點擊重置清冊刷新頁面，如仍無法顯示，需直接前往主管稅務機關的辦稅服務廳進行補申報。
對於只在稅期內申報了壹部分印花稅的情況，如某些稅目未申報，電子稅務局的逾期申報功能同樣無法使用，需要前往稅務機關的實體辦稅大廳進行補報。例如，企業被要求對四個稅目進行定期申報，但若只在系統中采集並申報了壹個有稅款需繳的稅目，其他零申報的稅目未處理，這時不能依賴電子稅務局的逾期申報功能，而是需要到稅務機關現場補辦。