二、如果增值稅專用發票抵扣聯、發票聯均丟失，就需由銷方單位到其主管稅務機關申請開具抄報稅證明單。銷方在發票開具當月丟失，銷方主管稅務機關不得出具此證明單,必須在次月企業報稅完成後才能開具。開具此證明單時，必須有壹方要處罰，處罰原則壹事不二罰，誰丟失誰接受處罰。
1、如屬購方丟失，購方憑借銷方提供的記賬聯復印件先到所屬稅務機關接受處罰，並將稅務機關處罰決定書原件郵寄或傳真給銷方，銷方帶公章、記賬聯復印件（2份）及購方提供的處罰決定書到所屬稅務機關申請開具抄報稅證明單。銷方將稅務機關開具的抄報稅證明單及記賬聯復印件提供給購方即可去購方所屬稅務機關認證抵扣。
2、如屬銷方丟失，銷方攜公章、記賬聯復印件（2份）到稅務機關接受處罰並申請開具抄報稅證明單，銷方將稅務機關開具的抄報稅證明單及記賬聯復印件提供給購方即可去購方所屬稅務機關認證抵扣。
3、購方應及時攜公章、抄報稅證明單、記賬聯復印件（2份）至其主管稅務機關申請補認證、補抵扣，稅務機關受理時發放丟失發票認證、抵扣申請表二份，報經批準，認證。