壹、概念不同
1、增值稅發票：增值稅專用發票是由國家稅務總局監制設計印制的，只限於增值稅壹般納稅人領購使用的。
2、普通機打發票：指在購銷商品、提供或接受服務以及從事其他經營活動中，所開具和收取的收付款憑證。
二、用處不同
1、增值稅發票：具有商事憑證的作用，由於實行憑發票註明稅款扣稅，購貨方要向銷貨方支付增值稅。它具有完稅憑證的作用。更重要的是，增值稅專用發票將壹個產品的最初生產到最終的消費之間各環節聯系起來，保持了稅賦的完整，體現了增值稅的作用。
2、普通機打發票：任何單位和個人在購銷商品、提供或接受服務以及從事其他經營活動中，除增值稅壹般納稅人開具和收取的增值稅專用發票之外，所開具和收取的各種收付款憑證均為普通發票。
三、構成不同
1、增值稅發票：增值稅普通發票由基本聯次或者基本聯次附加其他聯次構成，基本聯次為兩聯：發票聯和記賬聯。
2、普通機打發票：開具發票時，項目填寫齊全，字跡清楚，全部聯次壹次性復寫或打印，應當按號碼順序填開，未實行蓋章出門的要在發票聯加蓋發票專用章或財務專用章。使用電子計算機開具發票的，須經稅務機關批準，使用稅務機關監制的機外發票，開具後的存根聯應按照順序號裝訂成冊。
百度百科 -增值稅發票
百度百科-普通發票