診所營業執照辦理程序如下：
1、準備好材料：在辦理營業執照之前，首先要把相關的申報材料準備齊全。
2、核準店鋪名稱：到當地的工商部門提交個人辦理材料，同時填寫個人相關信息，工商部門會對店鋪進行名稱核對。
3、開具驗資報告：到銀行去開設賬戶並且和銀行工作人員申請開具驗資報告。
4、辦理營業執照：把驗資報告和工商部門讓開具的其他材料壹並交與工商部門進行核查，核查無誤後下發營業執照。
5辦理代碼證：到當地的質監部門去申請辦理代碼證。
6、辦理稅務登記：去當地稅務部門辦理稅務登記並開具相關證明。
7、開設基本銀行賬戶：需要到銀行開設戶頭，用於稅費的繳納。
法律依據：《醫療機構管理條例》
第十四條 醫療機構執業，必須進行登記，領取《醫療機構執業許可證》；診所按照國務院衛生行政部門的規定向所在地的縣級人民政府衛生行政部門備案後，可以執業。
第十五條 申請醫療機構執業登記，應當具備下列條件：
（壹）按照規定應當辦理設置醫療機構批準書的，已取得設置醫療機構批準書；
（二）符合醫療機構的基本標準；
（三）有適合的名稱、組織機構和場所；
（四）有與其開展的業務相適應的經費、設施、設備和專業衛生技術人員；
（五）有相應的規章制度；
（六）能夠獨立承擔民事責任。