法律分析：1、土地部分對應的賠償款項，免征；2、房屋部分對應的賠償款項，文件沒有明確免征；實務中，如果房屋被政府收回後拆除了，壹般不予征收；未拆除的需要過戶給政府的，應該繳納；3、機器部分對應的賠償款項，應該征收；實務中，如果機器設備作為廢品處理了，壹般不予征收；能正常使用需要轉移所有權給政府或政府指定單位的，應該征收；4、其他如搬遷獎勵等，由於不屬於增值稅應項項目，因此不征。
法律依據：《企業政策性搬遷所得稅管理辦法》 第四條 企業應按本辦法的要求，就政策性搬遷過程中涉及的搬遷收入、搬遷支出、搬遷資產稅務處理、搬遷所得等所得稅征收管理事項，單獨進行稅務管理和核算。不能單獨進行稅務管理和核算的，應視為企業自行搬遷或商業性搬遷等非政策性搬遷進行所得稅處理，不得執行本辦法規定。