有償方式兼並的，按照各項資產評估確認的價值，借記所有資產科目，按照成交價值高於評估確認的凈資產的差額，借記“無形資產—商譽”科目，按照確認的各項負債數額，貸記所有負債科目，按照確定的成交價值，貸記“專項應付款—應付兼並企業款”科目。企業支付價款時，借記“專項應付款—應付兼並企業款”科目，貸記“銀行存款”科目。采取無償劃轉方式兼並的，應按各項資產、負債評估確認的價值，借記所有資產科目，貸記所有負債科目，兩者之間如有差額，貸記“實收資本”科目。二是兼並企業仍保留法人資格情況下的處理。企業有償兼並其他企業，作為長期投資處理，按支付的價款借記“長期投資”科目，貸記“銀行存款”科目。資產評估增值的稅務處理可以分為三種情況：
納稅人按照國務院的統壹規定，進行清產核資時發生的固定資產評估凈增值，不計入應納稅所得額。
納稅人在產權轉讓過程中，發生的產權轉讓凈收益或凈損失，計入應納稅所得額，依法繳納企業所得稅。國有資產產權轉讓凈收益凡按國家有關規定全額上繳財政的，不計入應納稅所得額。
企業進行股份制改造發生的資產評估增值，應相應調整帳戶，所發生的固定資產評估增值可以計提折舊，但在計算應納稅所得額時不得扣除。