第壹，對象不同。稅務師主要為社會涉稅代理服務培養人才，可稱為稅務師或社會稅務師。稅收管理員主要是為企業的涉稅崗位培養人才，可以稱為稅收管理員，也可以稱為企業稅務師。
第二，等級設置不同。稅務師只有壹個證，五門考試科目全部通過才能拿證。稅務管理員根據崗位能力設置三級證書，分別通過考核並頒發相應級別的證書。
第三，適用範圍不同。稅務師是在稅務代理機構工作所需的資格證書。稅收管理員是企業中的稅務員、稅務經理、稅務主管等涉稅崗位的職業能力證書。