根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》規定,納稅人向索取增值稅專用發票的買方開具增值稅專用發票,增值稅專用發票上分別註明銷售額和銷項稅額。單位購買電動自行車屬於應稅銷售,可以向稅務局申請開具增值稅專用發票。購買次數沒有具體限制。只要符合增值稅開票的條件和要求,單位就可以根據需要購買電動自行車,並開具相應的發票。