黨組織工作經費在計算企業所得稅時是可以稅前扣除的。實際支出不超過職工年度工資薪金總額1%的部分是可以扣除的。
根據《關於國有企業黨組織工作經費問題的通知》第二條 納入管理費用的黨組織工作經費,實際支出不超過職工年度工資薪金總額1%的部分,可以據實在企業所得稅前扣除。年末如有結余,結轉下壹年度使用。累計結余超過上壹年度職工工資總額2%的,當年不再從管理費用中安排。
擴展資料：
《中華人民***和國企業所得稅法》第五條 企業每壹納稅年度的收入總額，減除不征稅收入、免稅收入、各項扣除以及允許彌補的以前年度虧損後的余額，為應納稅所得額。
第七條 收入總額中的下列收入為不征稅收入：?
（壹）財政撥款；?
（二）依法收取並納入財政管理的行政事業性收費、政府性基金；?
（三）國務院規定的其他不征稅收入。?
龍巖市政府—— 關於國有企業黨組織工作經費問題的通知