1、找到付款方復印其發票聯，作為記賬憑證。
2、如果是地稅代開的發票，到開具發票的地稅辦稅服務大廳，找到此發票號碼（到征管軟件--發票開票系統，輸入納稅人名稱，應該能查詢到）找到發票號，再找到此發票存根聯，復印後，再蓋上“×××地稅局票證專用章”。妳可以做帳了！
3、關於處罰的問題，按照《中華人民***和國發票管理辦法》妳公司可能存在法律風險：
根據《中華人民***和國發票管理辦法》的規定，第三十六條 違反發票管理法規的行為包括：
（五）未按照規定保管發票的；
對有前款所列行為之壹的單位和個人，由稅務機關責令限期改正，沒收非法所得，可以並處1萬元以下的罰款。
但，妳按我告訴妳的第2點要求辦，稅務局壹般不會處罰的，稅務局只相信對方稅務局的證明。只是經驗之談，但願對妳解決問題有幫助！