電子臺賬系統建立了及時、完整、準確的發票電子臺賬數據庫，即發票信息數據庫。納稅人開具的發票的正面信息，包括漢字和數字內容，將被加密並實時上傳，以生成電子賬本數據庫。
電子總賬的使用涉及三個層面:
第壹級開票:所有企業都要通過增值稅開票系統開具發票，這個發票信息會傳到電子總賬系統。第二層存儲:電子臺賬系統接收所有公司的發票信息，全國聯網。
第三層篩選:稅局可以通過各種技術對電子賬本中的數據進行分析，這是查選案件的重要工具。