稅務查出發票是假的，稅務機關壹般會要求企業做稅務調整，如果企業是私自印制、偽造、變造發票的，由稅務機關沒收違法所得，沒收、銷毀作案工具和非法物品，並處1萬元以上5萬元以下的罰款；情節嚴重的，並處5萬元以上50萬元以下的罰款；對印制發票的企業，可以並處吊銷發票準印證；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
法律客觀：《中華人民***和國發票管理辦法》第三十八條私自印制、偽造、變造發票，非法制造發票防偽專用品，偽造發票監制章的，由稅務機關沒收違法所得，沒收、銷毀作案工具和非法物品，並處1萬元以上5萬元以下的罰款；情節嚴重的，並處5萬元以上50萬元以下的罰款；對印制發票的企業，可以並處吊銷發票準印證；構成犯罪的，依法追究刑事責任。前款規定的處罰，《中華人民***和國稅收征收管理法》有規定的，依照其規定執行。