房產契稅退稅在地方稅務局進行辦理。
壹、辦理退稅流程如下：
1、納稅人向其主管征收機關提出申請，領取並填寫《契稅退稅（款）申請審核表》，同時按照征收機關的要求報送有關資料。
2、征收機關確認報送資料齊全後，應當場受理退稅申請，並審核納稅人填寫的表格是否符合要求。
3、經查實，對情況屬實的，經辦人形成退稅意見，報分管處長、處長及分管局長審批後開具退稅憑證。同時，轉國庫處後在10個工作日內辦理完結退稅手續。
不符合退稅條件的，征收機關應及時做出明確答復和解釋。
4、對退還部分稅款的，納稅人持已批準的《契稅退稅（款）申請審核表》、《（契稅待解戶）暫存款通知單》及納稅申報資料等到契稅直征窗口，由窗口征收人員重新核定應納稅款並開具完稅證後，經辦人再開具退稅憑證，辦理退稅手續。
5、歸檔。經辦人將退稅憑證（第五聯）、《契稅退稅（款）申請審核表》（第壹聯）等退稅資料裝訂好，每半年交檔案管理人員歸檔。