《增值稅暫行條例》規定，非正常損失的購進貨物及相關的應稅勞務，非正常損失的在產品、產成品所耗用的購進貨物或者應稅勞務的進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。《增值稅暫行條例實施細則》明確，非正常損失是因管理不善造成被盜、丟失、黴爛變質等損失。《企業所得稅法》規定，企業實際發生的與取得收入有關的、合理的損失支出，準予在計算應納稅所得額時扣除。《企業所得稅法實施條例》明確，損失是指企業在生產經營活動中發生的固定資產和存貨的盤虧、毀損、報廢損失，轉讓財產損失，呆賬損失，壞賬損失，自然災害等不可抗力因素造成的損失以及其他損失。
申報的時候填寫增值稅申報表附表二進項稅額轉出對應欄次。