納稅是根據收入來確定的，與公司賬戶有款進帳無關。如果這100萬進帳是銀行借款，只需繳納借款合同的印花稅即可。如果是營業收入，就需要繳納增值稅（或營業稅）及附加稅，如果是欠款單位還來的款項，則無需繳稅。
稅收是指國家為了向社會提供公***產品、滿足社會***同需要、按照法律的規定，參與社會產品的分配、強制、無償取得財政收入的壹種規範形式。稅收是壹種非常重要的政策工具。稅收是中國政府財政收入最主要的來源，也是中國用以加強宏觀調控的重要經濟杠桿。依照稅收收入歸屬和征管管轄權限的不同，中國稅務部門可分為國稅和地稅兩個不同的系統。前者征收的主要是維護國家權益、實施宏觀調控所必需的稅種和關乎國計民生的主要稅種的部分稅收;後者則主要負責合適地方征管的稅種以增加地方財政收入。