請問：1、該分支機構的清算虧損400萬元能否在我總公司進行彌補？彌補方式是什麽？
2、新企業所得稅法中對該問題有何規定？
解答內容：根據《中華人民***和國企業所得稅法》第五十條規定：居民企業在中國境內設立不具有法人資格的營業機構的，應當匯總計算並繳納企業所得稅。同時第十八條規定：企業納稅年度發生的虧損，準予向以後年度結轉，用以後年度的所得彌補，但結轉年限最長不得超過五年。第五十三條規定：企業依法清算時，應當以清算期間作為壹個納稅年度。第五十五條規定：企業應當在辦理註銷登記前，就其清算所得向稅務機關申報並依法繳納企業所得稅。
因此，依據上述規定，貴公司若為具有法人資格獨立核算的企業所得稅納稅人，不屬於匯總納稅企業，則應按照企業所得稅法的相關規定進行註銷清算程序。