廣西壯族自治區地方稅務局內設機構：辦公室、政策法規處、征管和科技發展處、勞務稅處、財產和行為稅處、所得稅處、重點稅源管理處、納稅服務處（行政審批處）、收入規劃核算處、財務管理處、督察內審處、人事處（離退休人員工作處）、機關黨委（基層工作處），同時設有稅收科研所、機關後勤服務中心、計算機信息管理中心3個事業單位；稽查局、直屬稅務分局2個直屬機構；自治區紀委、監察廳派駐機構監察室1個。此外，還設有***青團廣西壯族自治區地方稅務系統工作委員會；與自治區國稅局聯合設置機構註冊稅務師管理中心；婦女工作辦公室、老幹部工作辦公室、巡視督查辦公室。
截止2009年底，廣西地稅系統***有南寧市、柳州市、桂林市、梧州市、北海市、欽州市、防城港市、貴港市、玉林市、崇左市、來賓市、賀州市、百色市、河池市等14個市地方稅務局， 46個城區（開發區）、75個縣（市）地稅局。