中華人民共和國國家稅務局直屬中華人民共和國和國務院管轄。1998年3月29日，國務院發布《國務院關於機構設置的通知》(國發[1998]5號)；同年6月22日，國務院辦公廳印發《中華人民共和國直轄市國家稅務局內設機構和人員編制規定》的通知，正式成立中華人民共和國國家稅務總局(正部級)。