貨運代理的發票有兩種:壹種是運輸發票，中國，以運輸企業的名義直接與需要運輸的單位(最好是貨物運輸業自開票納稅人)簽訂運輸合同，以運輸企業的名義直接向托運人(或收貨人)開具貨物運輸業發票。另壹種是境外貨運發票，即貨代發票。兩張發票都是稅務機關開具的正式發票。