第二，稅務機關的調查程序。稅務機關應當對申請減稅、免稅的納稅人的生產經營情況以及與申請減稅、免稅有關的其他情況進行調查。
三、納稅人是否具備減免稅資格的審查和認定程序。申請減免稅的納稅人必須具備壹定的資格。如果是國家有關部門認定的高新技術企業、有出口退稅權的企業、符合減免稅條件的福利企業等。
第四，審批程序。納稅人的減免稅資格需要審批。財政部的人在辦理減、免、退手續時也需要辦理審批手續。
五、辦理減、免、退稅手續。特別是享受先征後退減免稅政策的納稅人，壹定要嚴格按照退庫程序進行退庫。