1979年12月，呼和浩特市革命委員會改稱呼和浩特市人民政府，為內蒙古自治區人民政府領導下的壹級地方政權。市人民政府改稱後，經1983年和1995年兩次機構改革後，至1999年，市人民政府下設有辦公廳、計劃委員會、經濟貿易委員會、經濟體制改革委員會、科學技術委員會、民族事務委員會、教育委員會、公安局、國家安全局、民政局、司法局、財政局、人事局、機構編制委員會辦公室、勞動局、建設局、建築工程管理局、紡織工業局、機械工業局、輕化工業局、電子工業局、建築材料工業局、交通局、水利局、農業局、畜牧副食品局、林業局、商務局、糧食管理局、對外貿易經濟合作局、文化局、廣播電視局、衛生局、體育運動委員會、計劃生育委員會、審計局、統計局、物價局、工商行政管理局、環境保護局、土地管理局、房產管理局、技術監督局、鄉鎮企業局、外事辦公室、人民防空辦公室、地方稅務局等工作部門。時轄新城區、玉泉區、回民區、郊區、土默特左旗、托克托縣、和林格爾縣、清水河縣、武川縣等4區1旗4縣。