電子稅務局本身不能刪除收稅人，但是由於收稅人本身是公司法定代表人授權的，如果需要刪除收稅人或者更換收稅人，法人可以在電子稅務局中解除收稅人的權限，這樣收稅人就不能再處理企業的稅務事務了。
進入電子稅務局，點擊電子稅務局右上角的“登錄”按鈕，在“企業業務辦理”選項卡中選擇登錄方式。必須在登錄頁面上選中“驗證者類型”復選框。登錄時，必須以法人或財務控制人身份登錄。登錄後進入“我的信息”-“用戶管理”-“納稅人信息維護”進行操作。