按照方便、就近的原則，選擇自行辦理年度匯算清繳或者委托第三方(涉稅專業服務機構或者其他單位和個人)辦理申報的，應當向任職單位(包括按照累計扣繳法為您代扣代繳勞務報酬個人所得稅的單位)主管稅務機關申報；如果有兩個以上的用人單位，可以選擇其中壹個進行申報。未就業的，應向住所地、經常居住地或主要收入來源地主管稅務機關申報。無論您選擇網上申報還是前往稅務機關辦稅服務廳，受理您年度匯算清繳申報的主管稅務機關均按上述規則確定。
選擇由單位代為進行綜合所得年度匯算清繳的，可以直接向單位報送相關資料，由單位在年度匯算清繳期間向其主管稅務機關進行申報。