稅務機關查稅的基本程序是：
壹、選案：根據案源信息篩選，決定是否立案
二、立案接下來，如果符合條件就要進行立案，立案之後就是檢查程序，根據檢查結果制作《稅務稽查報告》。實施檢查之日起60日內完成，確需延長檢查時間的，應當經稽查局局長批準。最後就是審理程序，檢查完畢，檢查部門應當將《稅務稽查報告》、《稅務稽查工作底稿》及相關證據材料，在5個工作日內移交審理部門審理，並辦理交接手續。審理部門接到檢查部門移交的《稅務稽查報告》及有關資料後，應當在15日內提出審理意見，但下列時間不計算在內：
（壹）檢查人員補充調查的時間；
（二）向上級機關請示或者向相關部門征詢政策問題的時間。案情復雜確需延長審理時限的，經稽查局局長的批準，可以適當延長。
法律依據：《稅務稽查工作規程》第五條 稽查局查處稅收違法案件時，實行選案、檢查、審理、執行分工制約原則。 稽查局設立選案、檢查、審理、執行部門，分別實施選案、檢查、審理、執行工作。
：稽查審理是稅務局稽查局的審理部門按照規定的職責和程序，對稽查中的涉法進行審核和作出處理決定的過程。