壹、兩者的應用不同：
1、DAPI的應用：可以用於活細胞和固定細胞的染色。
2、hoechst的應用：主要用於活細胞標記。
二、兩者的特點不同：
1、DAPI的特點：當DAPI與雙股DNA結合時,在熒光顯微鏡觀察下，DAPI染劑在358nm(紫外線)處有壹個最大吸收峰，並在461nm(藍)處有壹個最大發射峰，其發射光的波長範圍含蓋了藍色至青綠色，因此在熒光顯微技術中DAPI被紫外線照亮且被藍或青色濾鏡檢出。
2、hoechst的特點：Hoechst染料的熒光強度隨著溶液pH升高而增強。
三、兩者的概述不同：
1、DAPI的概述：DAPI即4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole)，是壹種能夠與DNA強力結合的熒光染料，常用於熒光顯微鏡觀測。
2、hoechst的概述：Hoechst染料溶於水和有機溶劑，如二甲基甲酰胺或二甲基亞碸。濃度可高達10mg/mL.水溶液可在4 °C避光保存至少6個月。長期儲存於≤-20 °C。
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