根據百度百科，食品加工業的行政主管部門包括國家市場監督管理總局、國家發改委、商務部和各級商務主管部門。
辣椒加工企業屬於食品加工企業，需要辦理的主要證件有:工商營業執照、稅務登記證、食品衛生許可證、員工健康證。