1、註銷登記，首先，民辦非企業單位需要向原登記機關申請註銷登記，並按照相關規定提交註銷登記所需的材料。
2、稅務註銷，稅務機關會對民辦非企業單位的稅務情況進行清算和檢查，有欠稅情況需繳納。
3、資產移交，民辦非企業單位需要將所有資產包括固定資產、流動資產，移交給新的事業單位，並按照相關規定辦理資產轉移手續。
4、稅務申報，民辦非企業單位需要按照相關規定進行稅務申報，包括申報納稅、報送財務報表。