南京審計學院研究生都有：審計學專業、會計學專業、企業管理專業、技術經濟及管理、區域經濟學、財政學、金融學、西方經濟學、人口、資源與環境經濟學等專業。
南京審計大學研究生院現有碩士學位授權壹級學科7個、二級學科25個、工程碩士授權領域4個，多數研究生招生學科在計量、檢測、質量、檢驗檢疫等方面具有鮮明的特色。
南京審計大學占地面積2178畝，建有浦口、莫愁兩個校區；設有18個院（部），擁有29個本科專業；有全日制在校生15237人，其中普通本科在校生14094人，碩士研究生243人，留學生90人。是壹所以審計為品牌，經、管、法、工、文、理等學科相互支撐、協同發展的財經類院校。