南京市國家稅務局稽查局內設辦公室、人事教育監察科、綜合選案科、案件審理科、案件執行科、稅務違法案件舉報中心、檢查壹科、檢查二科、檢查三科等9個科室。現有在編幹部92人，其中：男50人，女42人；碩士研究生學歷6人，本科學歷59人，大專學歷24人，中專及以下學歷3人；***產黨員45人，民主黨派5人，團員1人，無黨派41人。現有離退休幹部23人，其中：離休幹部1人，退休幹部22人。